php 5.2.4で「Error in my_thread_global_end(): 1 threads didn't exit」エラーが解消したっぽい
php5.2.4にしたサーバでエラーが出なくなって安定稼働しているです。
参考記事：「「Error in my_thread_global_end(): 1 threads didn't exit」というエラー」
参考記事：「php 5.2.4リリース」
そもそもこれ、Windows環境だけだとか、Windowsでも特定の環境だけなんじゃないかとか言われておりましたが、総合してphp5.2.4で解消されたっぽいです。
一先ずご報告。